Задължителен елемент при разработването и въвеждането на НАССР система е анализа на опасностите. Целта на този анализ е да се изготви списък на опасностите, които, при липса на контрол, могат да се проявят и да предизвикат нараняване или хранително отравяне на потребителите. Анализирането на опасностите преминава през два етапа:
- Идентификация на опасностите
- Оценка на опасностите

